源資國際生物科技股份有限公司 Tri-I Biotech Inc

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源資國際生物科技股份有限公司 Tri-I Biotech Inc 公司成立於2000年,以創新(Innovation)之理念(Ideal),提供客戶整合性 (Integration)

【實驗技術系列- 基因拷貝數的檢測方法 (Gene Copy Number Detection- NGS)  】       正常情況下,人類屬於二倍體生物,絕大多數基因在體內都有兩個拷貝 (分別來自父母雙方)。當特定基因的片段發生重複 (...
12/06/2026

【實驗技術系列- 基因拷貝數的檢測方法 (Gene Copy Number Detection- NGS) 】

正常情況下,人類屬於二倍體生物,絕大多數基因在體內都有兩個拷貝 (分別來自父母雙方)。當特定基因的片段發生重複 (Gain/Amplification)或缺失 (Loss/Deletion)時,將會導致染色體中局部基因數量偏離基準,這種大片段基因數量的改變便稱為拷貝數變異 (Copy Number Variation, CNV) (圖一)。這種數量的異常會直接影響下游蛋白質的表現量,破壞細胞內的生理平衡,進而引發細胞功能異常或引發疾病。

利用次世代定序 (NGS)方法針對基因組進行高通量定序,透過比對序列讀取深度 (Read Depth),可以數位化地評估特定基因在基因組中的拷貝數目變化。比較常見的分析軟體如 CNVkit 或是 GATK 皆可以進行此類分析。而在分析過程中,軟體需先將人類參考基因組切成無數個微小的計數區間,並精確計算每個區間內序列的讀取數 (Reads Count)。為了消除實驗與 GC 含量所帶來的系統性偏誤,通常還需要引入一組由多個健康檢體建立的正常對照組進行基準評估。若某基因區域定序出來的數據量顯著高於正常對照組,具有重複或放大的現象,代表該基因的拷貝數有增加的現象;反之,若該區域的數據量顯著低於正常對照組,該基因遭遇缺失,則代表基因的拷貝數有減少的現象。

第三代定序具備超長序列 (Long Reads)的優勢,使用第三代定序技術 (如 Nanopore)的長讀長定序資料進行基因拷貝數變異分析,單一條序列便能展現較大的空間跨度,可以直接跨過正常及異常區域。比較常見的分析軟體如 EPI2ME 即可進行此類分析。這種特性讓生信演算法能夠擺脫傳統短序列的統計推論限制,直接在單鹼基解析度下,高準確度地尋找到其異常的斷點位置 (Breakpoints),為精準醫療提供更直觀且精確的結構變異證據。



【產品新知系列- 蛋白質表現與純化服務 】       蛋白質是許多生物技術與藥物開發的核心。無論是研究蛋白質結構、酵素功能,或是開發抗體與生技藥物,如何高效獲得高品質的目標蛋白質始終是實驗室與生技公司面臨的關鍵課題。 瑞斯科力生物科技提供...
05/06/2026

【產品新知系列- 蛋白質表現與純化服務 】

蛋白質是許多生物技術與藥物開發的核心。無論是研究蛋白質結構、酵素功能,或是開發抗體與生技藥物,如何高效獲得高品質的目標蛋白質始終是實驗室與生技公司面臨的關鍵課題。
瑞斯科力生物科技提供以大腸桿菌為基礎的蛋白質表現與純化服務,涵蓋傳統活細胞表現系統與無細胞蛋白質合成系統 (Cell-Free Protein Synthesis, CFPS)兩大技術平台,無論您是進行基礎研究、酵素開發、抗體生產,或是藥物篩選,我們會根據你的蛋白質特性,評估與協助您快速獲得高品質的目標蛋白質。

方案 A:傳統大腸桿菌蛋白質表現系統(穩健、高產、高性價比)
傳統方法將目標基因轉殖(transformation)入大腸桿菌中,透過誘導(Induction)大量表現目標蛋白質,再經由細胞破碎、離心、層析純化等步驟獲得最終產物。如果需要大量的蛋白質(如結晶結構生物學、抗原生產、或是常規的酵素活性測試),傳統的大腸桿菌活細胞系統依然是目前最成熟、成本效益最高的首選。

方案 B:無細胞蛋白質合成(CFPS)系統(極速、跨越毒性、無限客製)
無細胞蛋白質合成系統打破了活細胞的限制,直接在試管中建立蛋白質合成的核心機制。利用來自大腸桿菌的細胞萃取物,提供核糖體、tRNA、胺基酸與能量分子 (ATP等),只需加入目標基因的DNA模板,即可在數小時內完成蛋白質合成。如果目標蛋白非常特殊,如細胞膜蛋白、核糖核酸酶 (Nuclease)、或是會干擾宿主代謝的細胞毒素,在傳統系統中無法表現,就可以考慮使用CFPS 系統。

簡單建議:
✔️ 若您的目標蛋白為一般重組蛋白或酵素,且需要較高的總產量,傳統大腸桿菌系統是可靠的選擇。

✔️ 若您的蛋白具有細胞毒性、屬於膜蛋白或抗體片段,或需要快速取得樣本進行測試,無細胞系統將為您節省大量時間與心力。

立即聯絡我們,索取專屬的蛋白質純化評估報告與專案優惠!




#瑞斯科力生物科技

【實驗技術系列-無細胞蛋白質合成 (Cell-Free Protein Synthesis, CFPS)  】What?這是什麼?       無細胞蛋白質合成 (CFPS),顧名思義,就是在沒有活細胞的環境下,直接利用細胞蛋白質合成的核心...
29/05/2026

【實驗技術系列-無細胞蛋白質合成 (Cell-Free Protein Synthesis, CFPS) 】

What?這是什麼?

無細胞蛋白質合成 (CFPS),顧名思義,就是在沒有活細胞的環境下,直接利用細胞蛋白質合成的核心原料,在試管中進行體外 (in vitro)蛋白質表達。這些核心原料包括:核糖體、tRNA、胺基酸,以及提供能量的 ATP 與 GTP 等。只要將帶有目標基因的 DNA 或 mRNA 模板加入含有這些原料的反應體系中,系統就會自動啟動轉錄與轉譯機制,開始生產目標蛋白質。

How?怎麼做到?

CFPS 的核心關鍵在於細胞萃取物 (Cell extract/lysate)的製備。傳統上,科學家會利用大腸桿菌 (E. coli)、麥胚芽 (Wheat Germ)、兔網織紅血球 (RRL)或昆蟲細胞作為原料來源 (詳見表一)。透過物理破碎 (如超音波)或化學裂解的方式打破細胞膜或細胞壁,再經過高速離心去除細胞核、細胞壁碎片與不溶性組織,僅保留上清液中含有核糖體、RNA 聚合酶、轉譯因子及 tRNA 等關鍵組分。最後,額外補充能量再生系統 (如 ATP、GTP)與 20 種必需胺基酸,一套試管中的 CFPS 系統便大功告成。

近年來,另一種名為 PURE 系統 (Protein Synthesis Using Recombinant Elements)的技術直接將三十多種轉錄、轉譯所需的重組蛋白、因子與核糖體依精準比例進行人工混合。PURE 系統的優點是成分完全已知且極其純淨 (Defined),但缺點在於製備成本極高,且缺乏真核細胞複雜的轉譯後修飾 (PTM)能力。

Why?為什麼要用它?

在使用傳統的活細胞表現蛋白時 (如大腸桿菌或哺乳動物細胞),研究人員必須隨時注意細胞的生長狀況。從質體建構、基因轉殖、細胞培養、IPTG 誘導表達、到最後的細胞破碎與純化,往往需要耗費數天甚至數週的時間。相較之下,CFPS 展現了以下幾大優勢:

✔️ 極速製備:跳過了細胞生長與分盤培養的時間,製程能從數天縮短至數個小時。

✔️ 可控的開放式環境:因反應在試管中進行,研究人員可以隨時加入調整各種原料濃度,甚至能加入非天然的胺基酸 (Non-natural amino acids)或螢光標記,製造出帶有特殊化學修飾的蛋白質。

✔️ 可生產“毒蛋白”:有些蛋白質對活細胞具有毒性 (如膜蛋白、毒素、抗凍蛋白),細胞一旦表達就容易死亡,導致產量微乎其微。由於 CFPS 中沒有活細胞需要被保護,因此能製造出傳統方法難以取得的困難蛋白質。

✔️ 純化程序更簡單:因為沒有複雜的細胞雜質,省去了繁瑣的破菌步驟,讓後續的蛋白質純化變得輕鬆許多。

When?可以用在哪裡?

✔️ 高通量藥物與蛋白質篩選:利用微孔盤 (Microplate)在單一自動化平台上同時合成不同的蛋白質突變體,並直接進行配體結合或酵素活性測試,大幅加速新藥開發與標靶篩選的進程。

✔️ 合成生物學與體外工程:利用其開放式的操控環境,研究人員得以在試管中任意拼裝不同的酵素,建構出精準的體外代謝途徑 (Cell-free metabolic engineering),來生產生質燃料、稀有醣類或特殊化學品。

Summary 小總結

總結來說,CFPS 技術讓研究人員不需依賴細胞的複雜調控,改以更直接、更快速的方式,將目標基因轉譯成具有功能性的蛋白質。隨著技術不斷進步,無細胞合成系統正逐步在生物醫藥、綠色化學與精準醫療等領域中,扮演越來越重要的角色。



【NGS介紹系列- 單股DNA次世代定序方法 】       單股DNA普遍被發現於單股DNA病毒、古生物樣本DNA、cfDNA、環境DNA、FFPE樣本,ssDNA 的過量或持續存在,代表 DNA 損傷、複製壓力或病毒感染。       ...
22/05/2026

【NGS介紹系列- 單股DNA次世代定序方法 】

單股DNA普遍被發現於單股DNA病毒、古生物樣本DNA、cfDNA、環境DNA、FFPE樣本,ssDNA 的過量或持續存在,代表 DNA 損傷、複製壓力或病毒感染。

一般NGS通常為針對雙股DNA (dsDNA)接上adapter後進行文庫建構,目前有開發針對單股DNA (ssDNA) 的NGS試劑組,能夠直接在單股DNA末端接上adapter後建構文庫,減少雙股DNA合成過程中的錯誤偏好 (bias),保留單股分子特有的信息,適合用於處理微量或高度降解的樣本,可以應用於研究單股DNA病毒、古生物樣本DNA、cfDNA、環境DNA、FFPE樣本、與蛋白質相互作用的單股DNA或是CRISPR/Cas9基因編輯檢測等。

目前市面上常使用的ssDNA NGS文庫建構試劑組主要有二種:

🧬 sDNA-Seq Kit (Takara) (右圖):

✔️ 樣本中可同時含有單股及雙股DNA
✔️ 樣本DNA可偵測片段範圍50~600 bp
✔️ 樣本DNA起始量為10 pg~250 ng
✔️ 原理為利用Single-Strand DNA Ligase (SDL)直接將adapter接在單股DNA的3’端,接著加入引子進行extension合成互補股,最後再以傳統方式接上5’端的adapter,藉由此方式可生成具有方向性的文庫。
✔️ SDL的接合效率較低,最大的缺點為無法區別樣本DNA及adapter,故容易產生adapter dimer,導致大量定序數據的浪費。

🧬 xGen™ ssDNA & Low-Input DNA Library Prep Kit (IDT) (左圖):

✔️ 樣本中可同時含有單股及雙股DNA
✔️ 可偵測樣本最小DNA片段為40 bp
✔️ 樣本DNA起始量為10 pg~250 ng
✔️ 原理為利用Adaptase在單股DNA片段的3’端同時進行末端修飾 (Tailing)及adapter接合 (Ligation)反應,接著依序進行extension合成互補股及接上5’端的adapter,建構成具有方向性的文庫。
✔️ 為高度優化後的技術,其特色如下:

(1) 在單一試管內連續完成反應,不需中間純化,大幅降低樣本損失。
(2) 經由特殊的引子設計及Adaptase的酶活性,有效地抑制adapter dimer生成,以及具有較佳的接合 (Ligation)效率。
(3) 缺點為價格較昂貴。


【產品新知系列- 膠原蛋白檢測試劑 ( BindCOL™, biotin-conjugated, Funakoshi)】       膠原蛋白 (collagen)是動物體內最重要的細胞外基質 (extracellular matrix, ...
15/05/2026

【產品新知系列- 膠原蛋白檢測試劑 ( BindCOL™, biotin-conjugated, Funakoshi)】

膠原蛋白 (collagen)是動物體內最重要的細胞外基質 (extracellular matrix, ECM)成分之一,除了提供組織機械強度與支撐功能之外,膠原蛋白也參與細胞黏附、訊號傳遞、傷口修復與組織再生等重要生理過程。在正常狀態下,膠原蛋白通常以穩定的三股螺旋 (triple helix)結構存在,但在發炎、老化、纖維化、氧化壓力或機械性損傷等情況下,膠原蛋白會逐漸變性 (denaturation)或降解,導致其原有的立體結構解開成單股或雙股。如何準確偵測這些受損或變性的膠原蛋白,近年已成為組織損傷與疾病研究的重要方向。

BindCOL™ biotin-conjugated 是一種新型膠原蛋白檢測試劑,主要用途是專一性辨識「變性膠原蛋白 (denatured collagen)」。與傳統抗膠原蛋白抗體不同,BindCOL 並非利用抗原抗體反應進行辨識,而是採用特殊設計的 collagen-mimetic peptide(CMP)作為探針。此種設計的核心概念,是利用膠原蛋白本身具有 Gly-Pro-Hyp 重複序列的特性,使人工合成的胜肽能夠與已經解旋的膠原蛋白鏈重新形成類似三股螺旋的結構。因此,BindCOL 能夠高度專一地結合受損或變性的膠原蛋白區域,而不會與正常完整的膠原蛋白結合。

BindCOL產品特色 :

✔️ 對變性膠原蛋白具有高度選擇性。傳統 collagen antibody 往往無法區分 native collagen 與 denatured collagen,因此在組織損傷研究中容易產生背景訊號或誤判。然而 BindCOL 僅辨識結構已經鬆開的 collagen 區域,因此特別適合用於纖維化、發炎反應、軟骨退化與傷口修復等研究領域。

✔️ 步驟簡便,不需進行高溫預熱。早期的 CMP 探針在低溫下容易彼此聚集形成三聚體,因此在使用前通常必須先加熱至約95°C,再快速冷卻以維持單股狀態,操作相對繁瑣。BindCOL 則採用了特殊的 cyclic peptide 結構設計,可有效避免自我聚集,因此不需額外加熱步驟即可直接使用。這不僅降低實驗操作難度,也能減少背景訊號並提升檢測靈敏度。

✔️ 帶有 biotin 標記,訊號偵測可透過 streptavidin 系統完成。例如在 immunofluorescence 實驗中,可搭配 streptavidin-FITC 或 streptavidin-Alexa Fluor 進行螢光顯影;在 western blot 中則可使用 streptavidin-HRP 進行化學發光偵測。由於 SDS-PAGE 後的膠原蛋白通常已被變性,因此 BindCOL 在 western blot 上也能作為一種特殊的 collagen detection reagent 使用,甚至在某些情況下可以取代傳統 primary antibody。

在應用範圍方面,BindCOL 已被廣泛使用於多種疾病與組織損傷研究。於肺纖維化、肝纖維化與腎纖維化模型中,研究者可利用 BindCOL 觀察 ECM remodeling 與 collagen degradation 的分布情形;在傷口修復與再生醫學領域,則能追蹤膠原蛋白重新排列與組織修復過程。此外,在老化研究中,隨著膠原蛋白逐漸失去穩定性與完整性,BindCOL 也可作為評估組織退化的依據。

整體而言,BindCOL™ 與傳統膠原蛋白檢測試劑最大的差異,在於它能直接辨識「變性與受損的 collagen」,而非僅偵測膠原蛋白是否存在。這使它特別適合應用於纖維化、組織損傷、發炎、老化與 ECM remodeling 等研究領域。再加上其不需預熱、背景低、可跨多種 collagen subtype 使用,以及檢測方式靈活等優點,使 BindCOL 成為近年膠原蛋白研究中相當具有代表性的新型檢測工具。


#源資代理

【實驗室冷知識-  Agarose 瓊脂糖凝膠電泳膠片製備與跑膠】       瓊脂糖凝膠電泳 (Agarose Gel Electrophoresis)是分子生物學中分離 DNA 或 RNA 片段的核心技術。其原理是利用核酸分子帶負電的特...
08/05/2026

【實驗室冷知識- Agarose 瓊脂糖凝膠電泳膠片製備與跑膠】

瓊脂糖凝膠電泳 (Agarose Gel Electrophoresis)是分子生物學中分離 DNA 或 RNA 片段的核心技術。其原理是利用核酸分子帶負電的特性,在電場中向正極移動,由於分子大小差異,通過凝膠網狀孔徑時,大分子速率慢小分子速率快,分出差異。

一、 凝膠製備 (Gel Preparation)

1. 選擇濃度:根據目標片段大小決定瓊脂糖濃度,通常介於 0.7% 至 2.0% 之間。
🪢 高濃度 (如 2.0%):適合分離較小片段。
🪢 低濃度 (如 0.8%):適合分離較大片段。

2. 配置溶液:稱取適量瓊脂糖粉末,加入電泳緩衝液 (如TAE或TBE)。
🪢 注意:不可用水代替緩衝液,否則凝膠會在電泳時融化。

3. 加熱溶解:使用微波爐加熱,每隔30-60秒取出搖勻,直到溶液完全透明無顆粒。

4. 注膠凝固:待膠液冷卻至約 50–60°C (不燙手)時,加入核酸染料 (如 EtBr 或安全染料)並混勻。將膠液倒入模具中插上尺梳,靜置 20–30 分鐘 待其完全凝固。

二、 跑膠流程 (Running the Gel)

1. 上樣準備:
🪢 將凝膠放入電泳槽,倒入緩衝液使其完全淹沒膠體。
🪢 小心拔出尺梳,形成上樣孔。
🪢 將 DNA 樣品與 Loading Buffer (含指示染料如 bromophenol blue 和增重劑如甘油)按比例混合,以增加樣本密度並追蹤電泳進度。

2. 加樣 (Loading Samples):利用微量吸管將樣品和 DNA Marker (分子量標誌)小心加入孔中緩慢注入孔中。

3. 設定電壓:連接電源,注意 「黑負紅正」,DNA會由負極 (黑)向正極 (紅)移動。
🪢 建議電壓通常為 80V–150V。

4. 停止電泳:當追蹤染料移動至凝膠底部約 1.5–2 公分處時,關閉電源。

三、 結果觀察 (Visualization)

1. 成像:將凝膠置於紫外透射儀 (UV Transilluminator)或藍光透視儀下觀察條帶。

2. 判讀:片段越小,跑得越快、位置越靠下方。透過對比 DNA Marker 的位置可估算樣品的大小。


#瓊脂糖凝膠電泳

【實驗技術系列- 基因拷貝數的檢測方法-絕對定量 (Gene Copy Number Detection- qPCR & dPCR)】       在臨床診斷與基礎研究中,基因拷貝數尤為重要,可以藉此釐清基因上下游調控機制、辨別癌症基因位點...
24/04/2026

【實驗技術系列- 基因拷貝數的檢測方法-絕對定量 (Gene Copy Number Detection- qPCR & dPCR)】

在臨床診斷與基礎研究中,基因拷貝數尤為重要,可以藉此釐清基因上下游調控機制、辨別癌症基因位點以及監測環境品質等等。即時定量聚合酶連鎖反應 (Quantitative Real-time PCR, qPCR) 與 數位 PCR (Digital PCR, dPCR) 是最常被使用的兩大檢測技術。

1. 即時定量聚合酶連鎖反應 (qPCR): qPCR 是目前最普及的基因檢測技術,其原理是透過偵測螢光訊號來推算起始模板的濃度。
先建立標的基因的濃度與基因Ct值標準曲線:

(1) 以已知濃度帶有標的基因的plasmid進行序列稀釋 (通常是 10 倍稀釋,做 5-7 個點),上機後得到Ct值與其已知濃度的對數 (Log) 建立的線性回歸方程曲線。

(2) 建立公認已知基因拷貝數的參考基因 (Reference gene/Housekeeping gene)的gDNA濃度與Ct值標準曲線。

(3) 將測定樣本標的基因的Ct值先帶入線性回歸方程曲線取得標的基因的濃度,再將Ct值除以對應相同濃度參考基因的Ct值,取得校正係數 (Correction coefficient)。

(4) 將取得的標的基因濃度依質體分子量與莫耳數回推標的基因分子數並乘上校正係數得到絕對基因拷貝數。

優點:成本低廉、通量高、儀器普及、操作時間短。
缺點:相對定量:必須依賴標準品或內參基因容易有誤差且解析度有限。

2. 數位 PCR (Digital PCR, dPCR): dPCR是近年來的高端定量技術,它將傳統 PCR 反應系統分割成數以萬計的獨立微小反應單元,利用微流體技術將檢體隨機分配到數萬個獨立空間中,每個分區進行 PCR 擴增。擴增結束後,儀器會掃描每個分區的螢光訊號。有訊號代表該單元至少含有一個目標分子,無訊號代表該單元不含目標分子。由於某些分區最初可能包含多個分子,為了修正這個重疊誤差,系統會透過泊松分佈公式計算出初始樣本的精確濃度。
C= -ln(1-p)/V
其中 C為濃度,p為陽性分區比例,V為每個分區的體積。

優點:
⭐️ 絕對定量:不需標準曲線,直接得出分子個數,準確度高。
⭐️ 極高解析度
⭐️ 干擾性:對 PCR 抑制物的耐受度較高。

缺點:儀器與耗材成本較高、操作步驟相對較多。

在選擇檢測方法時,若目標是進行初步的基因篩選或預算有限,qPCR 是首選;若目標是臨床精確診斷、偵測極細微的拷貝數變化或是次世代定序檢體庫的定量等,Digital PCR 展現出無可取代的精準優勢。



【NGS介紹系列-10X Genomics 單細胞ATAC-seq介紹】       染色質 (Chromatin)是指細胞分裂間期細胞核內由DNA、組蛋白和非組蛋白,以及少量RNA組成的複合結構,它在細胞核中以珠鏈狀核小體 (Nucleo...
10/04/2026

【NGS介紹系列-10X Genomics 單細胞ATAC-seq介紹】

染色質 (Chromatin)是指細胞分裂間期細胞核內由DNA、組蛋白和非組蛋白,以及少量RNA組成的複合結構,它在細胞核中以珠鏈狀核小體 (Nucleosome)結構包覆DNA。核小體是組成染色質的基本單位,核小體摺疊形成高度壓縮的結構容納於細胞核中。當這個結構被改變時,啟動子 (promoter)、增強子 (enhancer)、抑制子 (repressor)、沉默子(Suppressor)等調控因子的位置被打開形成可調控的區域稱為染色質可及性(chromatin accessibility),此區域則稱為開放染色質或染色質可及區域。

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是研究染色質可及性的方法,其原理是利用Tn5轉位酶 (transposase)的特性,在開放的染色質區域,也就是不被核小體緊密包覆的區域,進行剪切並同時插入定序接頭 (tagmentation)或探針。這些開放區域通常與基因轉錄活性相關,藉由捕捉 (capture)開放區域的DNA序列,並透過高通量定序可以獲得開放染色質區域的表觀遺傳研究資訊。

10x Genomics所推出的Chromium Single Cell ATAC (Assay for Transposase Accessible Chromatin)單細胞技術,透過獨家Next GEM與barcoding技術,將ATAC-seq提升至單核層級,藉大規模比對細胞間染色質開放區域的差異,深入剖析各種轉錄因子 (enhancer、promoter、repressor)調控基因表現機制。10x Genomics還推出了單細胞多組學技術,在轉位酶 (transposase)處理的細胞核被封裝於油滴中後,帶有Barcode條碼的特殊凝膠珠可同時從核內捕捉DNA與mRNA,實現在同一核內的ATAC與轉錄組檢測。

以下為Chromium單細胞多組學ATAC-Seq 與基因轉錄表達實驗流程:

1. 從細胞或組織中分離出細胞核 (Nucleus),因為ATAC-seq主要作用在染色質上。10X平台建議使用新鮮或冷凍樣本,並有特定的Nuclei Isolation試劑及方法,來分離出樣本細胞核。10X Chromium實驗從單細胞核懸液開始。

2. 萃取出的單細胞核懸液細胞核樣本先用轉位酶 (transposase)對大量細胞進行轉位反應,這種酶優先切割開放染色質區域中的核DNA並加上部分接頭。

3. 隨後將轉位反應後的細胞核分成液滴,即GEM (Gel Beads-in-emulsion )技術。其中每個單個凝膠珠 (Gel Bead)含有唯一的10X條形碼。在GEM內,唯一的條形碼與單個細胞核內的mRNA和轉位DNA片段相連接。反應後,溶解GEM並混合,隨後進行產物純化、擴增及文庫構建。

4. 混合後的GEM製備出兩個文庫,一個用於RNA Sequencing,另一個用於ATAC分析。最後,透過在Illumina平台定序文庫,一次可獲得大量單細胞DNA染色質開放區域和基因表達的數據資料、進而得到遺傳相關的資訊、圖譜。

10X多組學這項技術能幫助研究者進一步了解從表觀遺傳學 (Epigenetics)的角度,理解基因表達是如何被調控的,以及可能調控是哪些基因、哪些位置,而不僅僅是觀察表現結果 (特定基因mRNA表現)。

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【產品新知系列- 法醫基因家譜學試劑組 (FGG myBaits Compass 1.2M SNP Kit) 】       您是否正在為陳年舊案中高度降解的骨骼、牙齒或毛髮檢體感到束手無策?或者,您正苦於檢體中混雜了大量環境微生物 DNA...
27/03/2026

【產品新知系列- 法醫基因家譜學試劑組 (FGG myBaits Compass 1.2M SNP Kit) 】

您是否正在為陳年舊案中高度降解的骨骼、牙齒或毛髮檢體感到束手無策?或者,您正苦於檢體中混雜了大量環境微生物 DNA,導致全基因組定序 (WGS) 的數據浪費,且分析成本居高不下嗎?別擔心,小編今天要來介紹由美國 Daicel Arbor Biosciences 公司所開發的專業級產品FGG myBaits Compass 1.2M SNP Kit。這款試劑組專為「法醫基因家譜學 (Forensic Genetic Genealogy, FGG)」量身打造,能協助鑑定人員從最具挑戰性的生物檢體中,精準提取高品質的遺傳資訊,打破傳統 DNA 鑑定技術的侷限!

在現代法醫調查中,當傳統的 STR (短串聯重複序列)比對無法在資料庫中找到匹配者時,法醫基因家譜學 (FGG) 就成為了破案的新希望。然而,法醫樣本通常面臨 DNA 高度破碎 (降解)或含量極微量的嚴峻挑戰。傳統的 DNA 晶片 (Microarray) 對 DNA 的完整性要求極高,而全基因組定序 (WGS) 則容易受到樣本中細菌 DNA 污染的干擾,產生大量無效數據。

myBaits Compass採用了先進的「液相雜交捕獲技術」(hybridization capture technology)。這項技術就像是在雜亂的 DNA 文庫中加入專門設計的「特製探針(Baits)」,能精準鎖定並富集人類特定的 120萬個 (1.2M) SNP 位點。
為什麼探針技術能優異地解決降解問題?
- 克服片段破碎:高度破碎的 DNA 片段通常短於 100 bp。傳統 PCR 擴增需要一對引子同時結合在片段兩端才能運作,若片段太短便無法擴增;而雜交捕獲只需片段與探針的一部分結合,就能像「釣魚」一樣被成功釣取。
- 排除環境干擾:雜交捕獲技術具備卓越的篩選能力,能像過濾網般排除非人類的 DNA,確保定序資源精確集中在人類 1.2M SNP 等關鍵位點上。

產品核心特色
- 超高通量 SNP 覆蓋量:針對人類全基因組約120萬個關鍵 SNP 位點進行捕捉,範圍涵蓋了體染色體、X 染色體、Y 染色體以及完整的粒線體基因組 (Mitogenome)。如此龐大的數據量,足以支持遠親 (如三代甚至更遠的表親)的親緣關係推斷,顯著縮小尋人範圍。
- 強大的抗污染與抗降解能力:基於雜交捕獲原理,即使人類 DNA 在總檢體中的佔比極低 (其餘多為環境微生物 DNA),myBaits Compass 依然能精準鎖定目標序列,是處理骨骼、風化樣本或陳年檢體的首選工具。

小編幫大家整理FGG myBaits Compass 1.2M SNP Kit的優點:
# 專為降解檢體設計:針對高度破碎的 DNA 片段仍有優異的捕獲效率,克服陳年舊案瓶頸。
# 極致的靈敏度:即使是低輸入量 (Low-input DNA) 的樣本,也能產出高覆蓋率、可供比對的 SNP 檔案。
# 高性價比分析:相較於全基因組定序 (WGS),僅針對關鍵 1.2M 位點定序,大幅降低定序深度需求與後續生物資訊運算成本。
# 全方位親緣解析:支持從近親到遠親的全面搜尋,並同步提供父系 (Y-STR/SNP) 與母系 (mtDNA) 的演化資訊。
這麼好用的試劑,趕快揪團來下單~

Arbor Biosciences
#降解樣本處理 #身份識別
#法醫基因家譜學

【實驗品管系列- 確保實驗結果有效性】        ISO/IEC 17025 是國際認可的實驗室品質管理與技術能力通用標準,為確保實驗結果有效性,其核心在於建立嚴謹的品質管制體系,透過內部品質管制(如使用標準物質、重複測試、管制圖)、外...
20/03/2026

【實驗品管系列- 確保實驗結果有效性】

ISO/IEC 17025 是國際認可的實驗室品質管理與技術能力通用標準,為確保實驗結果有效性,其核心在於建立嚴謹的品質管制體系,透過內部品質管制(如使用標準物質、重複測試、管制圖)、外部品質評估(認證稽核、能力試驗)、人員適任性、儀器維護校正、方法確證、環境控制等,並對管理系統持續改進,以確保實驗室能夠提供準確、可靠的檢測或校正結果。

具體「確保實驗結果有效性」的措施包括:

1. 內部品質管制 (Internal Quality Control, IQC)

📌標準物質/標準樣品的使用:定期使用標準物質/標準樣品驗證檢測結果。
📌重複測試:利用相同或不同方法進行重複試驗/校正,或對保留樣品進行再測試。
📌人員比對與設備比對:驗證不同人員或不同儀器間試驗結果的一致性。
📌管制圖 (Control Chart):使用管制圖監控長期數據,確保過程處於統計管制狀態。

2. 外部品質評估 (External Quality Assessment, EQA)

📌認證評鑑:獲得 ISO/IEC 17025 實驗室認證。
📌能力試驗:參加能力試驗執行機構舉辦的能力試驗或實驗室間比對,評估自身的技術能力。

3. 方法與儀器驗證

📌方法確證 (Method Validation):確保所選用的方法適用於預期用途,確認精密度、準確度、檢測極限等。
📌計量溯源 (Metrological Traceability):確保結果能追溯至國家標準或國際標準。
📌儀器維護與校正:定期校正設備,並保留完整的設備維護記錄。
📌量測設備的中間查核:確保量測設備在兩次校正期間維持穩定性與準確度。

4. 人員與環境管理

📌人員適任性:透過教育訓練、考核與授權,確保檢測人員具備相應的技術能力與資格。
📌環境控制:監控並記錄可能影響結果的環境條件(如溫度、濕度、潔淨度)。

5. 管理系統持續改進

📌風險與機會管理:實驗室應鑑別風險採取相應措施以防產出不正確的結果,並利用機會持續改善。
📌不符合工作處理:發現異常時立即改正並防止再次發生。
📌內部稽核與管理審查:透過系統性的內部稽核與管理階層審查,確認系統的有效性。

#源資生物科技核酸實驗室

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221新北市汐止區康寧街169巷25號5樓
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221

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